Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YPR150WYPR150W 522 nt5.82□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 PYC2YBR218C 3543 nt5.82□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 HST3YOR025W 1344 nt5.81□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 snR82snR82 268 nt5.81□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 RPT3YDR394W 1287 nt5.81□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.81□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.81□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YNL285WYNL285W 372 nt5.81□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 HEM15YOR176W 1182 nt5.81□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 RSA4YCR072C 1548 nt5.8□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 MDM31YHR194W 1740 nt5.8□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 GUD1YDL238C 1470 nt5.8□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 HXK2YGL253W 1461 nt5.8□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 RTT103YDR289C 1230 nt5.8□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YEL068CYEL068C 333 nt5.8□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 MRS3YJL133W 945 nt5.8□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 URA7YBL039C 1740 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 TEP1YNL128W 1305 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 PFK2YMR205C 2880 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 OAC1YKL120W 975 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 QRI5YLR204W 336 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 HAP3YBL021C 435 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 MRPL24YMR193W 777 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 GLN1YPR035W 1113 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 GPB2YAL056W 2643 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 PMT2YAL023C 2280 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YBR138CYBR138C 1575 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 UTP4YDR324C 2331 nt5.79□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 GEX2YKR106W 1848 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 ESC8YOL017W 2145 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YDR514CYDR514C 1452 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YGR127WYGR127W 939 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 RRT7YLL030C 342 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 SRV2YNL138W 1581 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 MRPS12YNR036C 462 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 NPT1YOR209C 1290 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 DAP1YPL170W 459 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YPR114WYPR114W 948 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 IFA38YBR159W 1044 nt5.78□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 PGK1YCR012W 1251 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 SRG1SRG1 551 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 UPS3YDR185C 540 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 SRN2YLR119W 642 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 JNM1YMR294W 1122 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YNL108CYNL108C 813 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YOL163WYOL163W 510 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 COA2YPL189C-A 207 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 ALG5YPL227C 1005 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YPR123CYPR123C 435 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 PEX32YBR168W 1242 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 KKQ8YKL168C 2175 nt5.77□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 GPI18YBR004C 1302 nt5.76□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 VHT1YGR065C 1782 nt5.76□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 COX9YDL067C 180 nt5.76□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 DOT5YIL010W 648 nt5.76□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YIR043CYIR043C 693 nt5.76□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 RPS5YJR123W 678 nt5.76□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 MTQ1YNL063W 945 nt5.76□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 PDB1YBR221C 1101 nt5.76□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YHL017WYHL017W 1599 nt5.76□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 QRI1YDL103C 1434 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 WHI4YDL224C 1950 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 RRP1YDR087C 837 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 MRS1YIR021W 1092 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 MTF1YMR228W 1026 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YOL079WYOL079W 399 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 STB5YHR178W 2232 nt5.75□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 THI4YGR144W 981 nt5.74□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 PML1YLR016C 615 nt5.74□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 PDR18YNR070W 4002 nt5.74□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YLH47YPR125W 1365 nt5.74□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 MNN5YJL186W 1761 nt5.74□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YDL129WYDL129W 876 nt5.73□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YHR095WYHR095W 495 nt5.73□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 MOG1YJR074W 657 nt5.73□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 APN1YKL114C 1104 nt5.73□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 ICT1YLR099C 1185 nt5.73□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 TIP41YPR040W 1071 nt5.73□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.73□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 SKS1YPL026C 1509 nt5.73□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YDR387CYDR387C 1668 nt5.72□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 ATG4YNL223W 1485 nt5.72□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YCR006CYCR006C 474 nt5.72□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 BUD32YGR262C 786 nt5.72□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 PRE3YJL001W 648 nt5.72□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YJR115WYJR115W 510 nt5.72□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YML083CYML083C 1257 nt5.72□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 CIN4YMR138W 576 nt5.72□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.72□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 MMR1YLR190W 1476 nt5.71□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 RAD24YER173W 1980 nt5.71□□□□□ -1.49
NMD4Q12129 LPL1YOR059C 1353 nt5.71□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 FRS2YFL022C 1512 nt5.71□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 RAM1YDL090C 1296 nt5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms