Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 TRP3YKL211C 1455 nt4.9□□□□□ -1.62
CSI2Q08054 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.9□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 RPE1YJL121C 717 nt4.9□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 CIN4YMR138W 576 nt4.9□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 ATG12YBR217W 561 nt4.9□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 MNN5YJL186W 1761 nt4.9□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 UBX2YML013W 1755 nt4.9□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 GUA1YMR217W 1578 nt4.9□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 MTC2YKL098W 1074 nt4.89□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 YOL131WYOL131W 327 nt4.89□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 ODC2YOR222W 924 nt4.89□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 DAP1YPL170W 459 nt4.89□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 COR1YBL045C 1374 nt4.89□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 PUF3YLL013C 2640 nt4.89□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 ERC1YHR032W 1746 nt4.89□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.89□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 VTH1YIL173W 4650 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 VTH2YJL222W 4650 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 GUD1YDL238C 1470 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 MRK1YDL079C 1506 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 EHD3YDR036C 1503 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 MDH3YDL078C 1032 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 CBP4YGR174C 513 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 HAP3YBL021C 435 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 AAD15YOL165C 432 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 EMW1YNL313C 2715 nt4.88□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 DBF4YDR052C 2115 nt4.87□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 VCX1YDL128W 1236 nt4.87□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 YOL163WYOL163W 510 nt4.87□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 ERI1YPL096C-A 207 nt4.87□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 HST3YOR025W 1344 nt4.87□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 CDC19YAL038W 1503 nt4.87□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 ASH1YKL185W 1767 nt4.86□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 PHO86YJL117W 936 nt4.86□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt4.86□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 UBC11YOR339C 471 nt4.86□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 GLN1YPR035W 1113 nt4.86□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 SSK22YCR073C 3996 nt4.86□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 TEP1YNL128W 1305 nt4.86□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 MNN2YBR015C 1794 nt4.86□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 RFA1YAR007C 1866 nt4.86□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 VPS1YKR001C 2115 nt4.85□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 PYC1YGL062W 3537 nt4.85□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 YDL119CYDL119C 924 nt4.85□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 CHO1YER026C 831 nt4.85□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 RPN11YFR004W 921 nt4.85□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 KKQ8YKL168C 2175 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 PET112YBL080C 1626 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 ATP1YBL099W 1638 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 ATF1YOR377W 1578 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 ATG4YNL223W 1485 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 SNZ3YFL059W 897 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 FZF1YGL254W 900 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 SSP120YLR250W 705 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 SNZ2YNL333W 897 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 YBR144CYBR144C 315 nt4.84□□□□□ -1.63
CSI2Q08054 ABZ1YNR033W 2364 nt4.84□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 NSE5YML023C 1671 nt4.83□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 BRL1YHR036W 1416 nt4.83□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 GPT2YKR067W 2232 nt4.83□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 RSC30YHR056C 2652 nt4.83□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 TAX4YJL083W 1815 nt4.83□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 ECM3YOR092W 1842 nt4.82□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 ATP4YPL078C 735 nt4.82□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 YFR006WYFR006W 1608 nt4.82□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 VRP1YLR337C 2454 nt4.82□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 TRP1YDR007W 675 nt4.81□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 RPT3YDR394W 1287 nt4.81□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 SUP19tS(UGA)E 82 nt4.81□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 SUP17tS(UGA)I 82 nt4.81□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 SUP16tS(UGA)P 82 nt4.81□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 RPL10YLR075W 666 nt4.81□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 ASF2YDL197C 1578 nt4.81□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 FRS2YFL022C 1512 nt4.81□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 ACC1YNR016C 6702 nt4.81□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 EIS1YMR031C 2532 nt4.8□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 RHB1YCR027C 630 nt4.8□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 RPR2YIR015W 435 nt4.8□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 MRPL22YNL177C 930 nt4.8□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 FRE3YOR381W 2136 nt4.8□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 RPS9AYPL081W 594 nt4.8□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 IFA38YBR159W 1044 nt4.8□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 PHB1YGR132C 864 nt4.79□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 RRT2YBR246W 1164 nt4.79□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 ERG7YHR072W 2196 nt4.79□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 YNL095CYNL095C 1929 nt4.79□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 BNA5YLR231C 1362 nt4.78□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 YEL077CYEL077C 3834 nt4.78□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 EXO1YOR033C 2109 nt4.78□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 SNU71YGR013W 1863 nt4.78□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 YGR022CYGR022C 330 nt4.78□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 TAL1YLR354C 1008 nt4.78□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 JIP4YDR475C 2631 nt4.78□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 ELP2YGR200C 2367 nt4.78□□□□□ -1.64
CSI2Q08054 YCL065WYCL065W 369 nt4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52 ms