Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB15P59190 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB15P59190 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB15P59190 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB15P59190 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB15P59190 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB15P59190 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB15P59190 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB15P59190 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB15P59190 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB15P59190 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB15P59190 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB15P59190 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB15P59190 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB15P59190 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB15P59190 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB15P59190 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB15P59190 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB15P59190 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB15P59190 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB15P59190 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB15P59190 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB15P59190 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB15P59190 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB15P59190 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB15P59190 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB15P59190 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB15P59190 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB15P59190 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB15P59190 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB15P59190 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB15P59190 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB15P59190 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB15P59190 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB15P59190 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB15P59190 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB15P59190 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB15P59190 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB15P59190 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB15P59190 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB15P59190 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB15P59190 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB15P59190 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB15P59190 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB15P59190 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB15P59190 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB15P59190 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB15P59190 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB15P59190 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB15P59190 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB15P59190 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB15P59190 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB15P59190 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB15P59190 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB15P59190 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB15P59190 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB15P59190 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB15P59190 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB15P59190 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB15P59190 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB15P59190 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB15P59190 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB15P59190 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB15P59190 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB15P59190 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB15P59190 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB15P59190 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB15P59190 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB15P59190 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms