Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 YLR283WYLR283W 945 nt5.91□□□□□ -1.46
SNF12P53628 PPA2YMR267W 933 nt5.91□□□□□ -1.46
SNF12P53628 ECM31YBR176W 939 nt5.91□□□□□ -1.46
SNF12P53628 RPL21AYBR191W 483 nt5.91□□□□□ -1.46
SNF12P53628 PDB1YBR221C 1101 nt5.91□□□□□ -1.46
SNF12P53628 MKC7YDR144C 1791 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 PMT2YAL023C 2280 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 VMA3YEL027W 483 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 GTO1YGR154C 1071 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 YJR056CYJR056C 711 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 SPC42YKL042W 1092 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 MEH1YKR007W 555 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 NMD4YLR363C 657 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 YNL108CYNL108C 813 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 RUF23RUF23 254 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 HEM15YOR176W 1182 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 CTF19YPL018W 1110 nt5.9□□□□□ -1.46
SNF12P53628 PYC2YBR218C 3543 nt5.9□□□□□ -1.47
SNF12P53628 ARH1YDR376W 1482 nt5.9□□□□□ -1.47
SNF12P53628 CLB2YPR119W 1476 nt5.9□□□□□ -1.47
SNF12P53628 CCT8YJL008C 1707 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YLR036CYLR036C 612 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 TAF9YMR236W 474 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YNL228WYNL228W 777 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 MRPS12YNR036C 462 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 PDR18YNR070W 4002 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 HOS1YPR068C 1413 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 VPS5YOR069W 2028 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 RCK1YGL158W 1539 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 PPT1YGR123C 1542 nt5.89□□□□□ -1.47
SNF12P53628 BZZ1YHR114W 1902 nt5.88□□□□□ -1.47
SNF12P53628 RAM1YDL090C 1296 nt5.88□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YEA6YEL006W 1008 nt5.88□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.88□□□□□ -1.47
SNF12P53628 PEX22YAL055W 543 nt5.88□□□□□ -1.47
SNF12P53628 COX17YLL009C 210 nt5.88□□□□□ -1.47
SNF12P53628 MRPS18YNL306W 654 nt5.88□□□□□ -1.47
SNF12P53628 DAP1YPL170W 459 nt5.88□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YTP1YNL237W 1380 nt5.88□□□□□ -1.47
SNF12P53628 MAF1YDR005C 1188 nt5.87□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YDR509WYDR509W 348 nt5.87□□□□□ -1.47
SNF12P53628 GTO3YMR251W 1101 nt5.87□□□□□ -1.47
SNF12P53628 TSR3YOR006C 942 nt5.87□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YPL168WYPL168W 1293 nt5.87□□□□□ -1.47
SNF12P53628 PTC4YBR125C 1182 nt5.87□□□□□ -1.47
SNF12P53628 PTR2YKR093W 1806 nt5.86□□□□□ -1.47
SNF12P53628 AMD2YDR242W 1650 nt5.86□□□□□ -1.47
SNF12P53628 MST1YKL194C 1389 nt5.86□□□□□ -1.47
SNF12P53628 SUB2YDL084W 1341 nt5.86□□□□□ -1.47
SNF12P53628 HSP150YJL159W 1242 nt5.86□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YML131WYML131W 1098 nt5.86□□□□□ -1.47
SNF12P53628 FOB1YDR110W 1701 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 MPC54YOR177C 1395 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YDL129WYDL129W 876 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 PCL9YDL179W 915 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 GCG1YER163C 699 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YPR123CYPR123C 435 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 ILV6YCL009C 930 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 GEX1YCL073C 1848 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 GUP2YPL189W 1830 nt5.85□□□□□ -1.47
SNF12P53628 CNE1YAL058W 1509 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YDR132CYDR132C 1488 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 YEF1YEL041W 1488 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 SAC6YDR129C 1929 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 PGK1YCR012W 1251 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 ARP1YHR129C 1155 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 POP5YAL033W 522 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 PSR2YLR019W 1194 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 SEC17YBL050W 879 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 RRP40YOL142W 723 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 ODC2YOR222W 924 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 AME1YBR211C 975 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF12P53628 PTK2YJR059W 2457 nt5.84□□□□□ -1.48
SNF12P53628 AMA1YGR225W 1782 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 YFL042CYFL042C 2025 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 CDC34YDR054C 888 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 MRPL25YGR076C 474 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 AIM20YIL158W 615 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 OMA1YKR087C 1038 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 SKN1YGR143W 2316 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 NOP2YNL061W 1857 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 MCM6YGL201C 3054 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF12P53628 GPD2YOL059W 1323 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 PCL6YER059W 1263 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 OM45YIL136W 1182 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 MPM1YJL066C 759 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 UBC12YLR306W 567 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 YLR311CYLR311C 348 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 YBR027CYBR027C 333 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 YMC1YPR058W 924 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 ALD6YPL061W 1503 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 EIS1YMR031C 2532 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF12P53628 ERG8YMR220W 1356 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF12P53628 SRG1SRG1 551 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF12P53628 MHO1YJR008W 1017 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF12P53628 YKR045CYKR045C 552 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF12P53628 RRT7YLL030C 342 nt5.81□□□□□ -1.48
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