Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YML018CYML018C 1182 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SEC17YBL050W 879 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YNL285WYNL285W 372 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 FRS2YFL022C 1512 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 CNE1YAL058W 1509 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 VPS4YPR173C 1314 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 ATG4YNL223W 1485 nt5.98□□□□□ -1.45
SEC28P40509 MCM3YEL032W 2916 nt5.98□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SNF11YDR073W 510 nt5.98□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YNR040WYNR040W 771 nt5.98□□□□□ -1.45
SEC28P40509 RDL1YOR285W 420 nt5.98□□□□□ -1.45
SEC28P40509 HOS1YPR068C 1413 nt5.98□□□□□ -1.45
SEC28P40509 RAP1YNL216W 2484 nt5.98□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YDR514CYDR514C 1452 nt5.97□□□□□ -1.45
SEC28P40509 RIO1YOR119C 1455 nt5.97□□□□□ -1.45
SEC28P40509 GAL83YER027C 1254 nt5.97□□□□□ -1.45
SEC28P40509 ARP1YHR129C 1155 nt5.97□□□□□ -1.45
SEC28P40509 GEP5YLR091W 882 nt5.97□□□□□ -1.45
SEC28P40509 ECM2YBR065C 1095 nt5.97□□□□□ -1.45
SEC28P40509 GUS1YGL245W 2127 nt5.96□□□□□ -1.45
SEC28P40509 ATG18YFR021W 1503 nt5.96□□□□□ -1.46
SEC28P40509 XBP1YIL101C 1944 nt5.96□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YHL018WYHL018W 363 nt5.96□□□□□ -1.46
SEC28P40509 PEX32YBR168W 1242 nt5.96□□□□□ -1.46
SEC28P40509 SSK1YLR006C 2139 nt5.95□□□□□ -1.46
SEC28P40509 LCP5YER127W 1074 nt5.95□□□□□ -1.46
SEC28P40509 ERG7YHR072W 2196 nt5.95□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.95□□□□□ -1.46
SEC28P40509 QRI5YLR204W 336 nt5.95□□□□□ -1.46
SEC28P40509 CIN4YMR138W 576 nt5.95□□□□□ -1.46
SEC28P40509 JNM1YMR294W 1122 nt5.95□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RBA50YDR527W 1320 nt5.95□□□□□ -1.46
SEC28P40509 FET3YMR058W 1911 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YDL129WYDL129W 876 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 FYV1YDR024W 486 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RPE1YJL121C 717 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YJL171CYJL171C 1191 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RPS5YJR123W 678 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YJU3YKL094W 942 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 CBT1YKL208W 816 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 VMA4YOR332W 702 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RAD24YER173W 1980 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 EIS1YMR031C 2532 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RSA4YCR072C 1548 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 FOB1YDR110W 1701 nt5.94□□□□□ -1.46
SEC28P40509 AAP1YHR047C 2571 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 ADK2YER170W 678 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 POR2YIL114C 846 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RPR2YIR015W 435 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 GCV3YAL044C 513 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RPS28AYOR167C 204 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 KEL1YHR158C 3495 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 GAT1YFL021W 1533 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 ALT1YLR089C 1779 nt5.93□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YER186CYER186C 921 nt5.92□□□□□ -1.46
SEC28P40509 HAP2YGL237C 798 nt5.92□□□□□ -1.46
SEC28P40509 DOT5YIL010W 648 nt5.92□□□□□ -1.46
SEC28P40509 OAC1YKL120W 975 nt5.92□□□□□ -1.46
SEC28P40509 IMD1YAR073W 1212 nt5.92□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.92□□□□□ -1.46
SEC28P40509 PYK2YOR347C 1521 nt5.92□□□□□ -1.46
SEC28P40509 CSC1YLR241W 2349 nt5.92□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YDR396WYDR396W 501 nt5.91□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RPN11YFR004W 921 nt5.91□□□□□ -1.46
SEC28P40509 PHB1YGR132C 864 nt5.91□□□□□ -1.46
SEC28P40509 MPM1YJL066C 759 nt5.91□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RPL10YLR075W 666 nt5.91□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.91□□□□□ -1.46
SEC28P40509 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.91□□□□□ -1.46
SEC28P40509 FLC3YGL139W 2409 nt5.91□□□□□ -1.46
SEC28P40509 SKS1YPL026C 1509 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 NOP2YNL061W 1857 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 BZZ1YHR114W 1902 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RNR3YIL066C 2610 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 RAD3YER171W 2337 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 COX20YDR231C 618 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 LEU5YHR002W 1074 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 DJP1YIR004W 1299 nt5.9□□□□□ -1.46
SEC28P40509 MET7YOR241W 1647 nt5.89□□□□□ -1.47
SEC28P40509 SPG1YGR236C 288 nt5.89□□□□□ -1.47
SEC28P40509 BUD32YGR262C 786 nt5.89□□□□□ -1.47
SEC28P40509 APN1YKL114C 1104 nt5.89□□□□□ -1.47
SEC28P40509 TAH18YPR048W 1872 nt5.89□□□□□ -1.47
SEC28P40509 MRC1YCL061C 3291 nt5.89□□□□□ -1.47
SEC28P40509 CCZ1YBR131W 2115 nt5.89□□□□□ -1.47
SEC28P40509 NSI1YDR026C 1713 nt5.88□□□□□ -1.47
SEC28P40509 HSP78YDR258C 2436 nt5.88□□□□□ -1.47
SEC28P40509 VPS5YOR069W 2028 nt5.88□□□□□ -1.47
SEC28P40509 HSP150YJL159W 1242 nt5.88□□□□□ -1.47
SEC28P40509 QRI1YDL103C 1434 nt5.88□□□□□ -1.47
SEC28P40509 YPK2YMR104C 2034 nt5.87□□□□□ -1.47
SEC28P40509 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.87□□□□□ -1.47
SEC28P40509 STB5YHR178W 2232 nt5.87□□□□□ -1.47
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