Protein–RNA interactions for Protein: P40157

VID27, Vacuolar import and degradation protein 27, yeastyeast

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID27P40157 ATG18YFR021W 1503 nt6.78□□□□□ -1.32
VID27P40157 TRP1YDR007W 675 nt6.78□□□□□ -1.32
VID27P40157 SNF11YDR073W 510 nt6.78□□□□□ -1.32
VID27P40157 RPN11YFR004W 921 nt6.78□□□□□ -1.32
VID27P40157 SOH1YGL127C 384 nt6.78□□□□□ -1.32
VID27P40157 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.78□□□□□ -1.32
VID27P40157 PUF3YLL013C 2640 nt6.78□□□□□ -1.32
VID27P40157 YBR284WYBR284W 2394 nt6.77□□□□□ -1.32
VID27P40157 GPB2YAL056W 2643 nt6.77□□□□□ -1.33
VID27P40157 RPE1YJL121C 717 nt6.77□□□□□ -1.33
VID27P40157 MTC2YKL098W 1074 nt6.77□□□□□ -1.33
VID27P40157 SSP120YLR250W 705 nt6.77□□□□□ -1.33
VID27P40157 RPT3YDR394W 1287 nt6.76□□□□□ -1.33
VID27P40157 MRPS12YNR036C 462 nt6.76□□□□□ -1.33
VID27P40157 MOD5YOR274W 1287 nt6.76□□□□□ -1.33
VID27P40157 YIL055CYIL055C 1884 nt6.76□□□□□ -1.33
VID27P40157 TEP1YNL128W 1305 nt6.76□□□□□ -1.33
VID27P40157 TRP5YGL026C 2124 nt6.75□□□□□ -1.33
VID27P40157 snR82snR82 268 nt6.74□□□□□ -1.33
VID27P40157 CBT1YKL208W 816 nt6.74□□□□□ -1.33
VID27P40157 YKR073CYKR073C 321 nt6.74□□□□□ -1.33
VID27P40157 YML131WYML131W 1098 nt6.74□□□□□ -1.33
VID27P40157 CDC19YAL038W 1503 nt6.74□□□□□ -1.33
VID27P40157 MCM3YEL032W 2916 nt6.73□□□□□ -1.33
VID27P40157 YDL119CYDL119C 924 nt6.73□□□□□ -1.33
VID27P40157 CIS3YJL158C 684 nt6.73□□□□□ -1.33
VID27P40157 YBR144CYBR144C 315 nt6.73□□□□□ -1.33
VID27P40157 SLX5YDL013W 1860 nt6.73□□□□□ -1.33
VID27P40157 FRS2YFL022C 1512 nt6.72□□□□□ -1.33
VID27P40157 MKC7YDR144C 1791 nt6.72□□□□□ -1.33
VID27P40157 IMA5YJL216C 1746 nt6.71□□□□□ -1.34
VID27P40157 ADK2YER170W 678 nt6.71□□□□□ -1.34
VID27P40157 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.71□□□□□ -1.34
VID27P40157 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.71□□□□□ -1.34
VID27P40157 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.71□□□□□ -1.34
VID27P40157 ERP2YAL007C 648 nt6.71□□□□□ -1.34
VID27P40157 CCP1YKR066C 1086 nt6.71□□□□□ -1.34
VID27P40157 APE3YBR286W 1614 nt6.7□□□□□ -1.34
VID27P40157 MDH3YDL078C 1032 nt6.7□□□□□ -1.34
VID27P40157 MRPL1YDR116C 858 nt6.7□□□□□ -1.34
VID27P40157 RPR2YIR015W 435 nt6.7□□□□□ -1.34
VID27P40157 YLR122CYLR122C 378 nt6.7□□□□□ -1.34
VID27P40157 YDR109CYDR109C 2148 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 RRP4YHR069C 1080 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 ICS3YJL077C 396 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 ACS1YAL054C 2142 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 MRPL22YNL177C 930 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 RPS9AYPL081W 594 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 GLN1YPR035W 1113 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 UTP9YHR196W 1728 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 CYC8YBR112C 2901 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 EFT2YDR385W 2529 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 EFT1YOR133W 2529 nt6.69□□□□□ -1.34
VID27P40157 RCK1YGL158W 1539 nt6.68□□□□□ -1.34
VID27P40157 EAF5YEL018W 840 nt6.68□□□□□ -1.34
VID27P40157 CBP4YGR174C 513 nt6.68□□□□□ -1.34
VID27P40157 DOM34YNL001W 1161 nt6.68□□□□□ -1.34
VID27P40157 RGD1YBR260C 2001 nt6.67□□□□□ -1.34
VID27P40157 GIT1YCR098C 1557 nt6.67□□□□□ -1.34
VID27P40157 PPM1YDR435C 987 nt6.67□□□□□ -1.34
VID27P40157 MRP17YKL003C 396 nt6.67□□□□□ -1.34
VID27P40157 CSC1YLR241W 2349 nt6.67□□□□□ -1.34
VID27P40157 RSC30YHR056C 2652 nt6.67□□□□□ -1.34
VID27P40157 PRP40YKL012W 1752 nt6.67□□□□□ -1.34
VID27P40157 BSC5YNR069C 1470 nt6.66□□□□□ -1.34
VID27P40157 PDR18YNR070W 4002 nt6.66□□□□□ -1.34
VID27P40157 COS6YGR295C 1146 nt6.66□□□□□ -1.34
VID27P40157 DJP1YIR004W 1299 nt6.66□□□□□ -1.34
VID27P40157 FET3YMR058W 1911 nt6.66□□□□□ -1.34
VID27P40157 RHB1YCR027C 630 nt6.65□□□□□ -1.34
VID27P40157 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.65□□□□□ -1.34
VID27P40157 YDL114WYDL114W 927 nt6.65□□□□□ -1.34
VID27P40157 RPL10YLR075W 666 nt6.65□□□□□ -1.34
VID27P40157 YML083CYML083C 1257 nt6.65□□□□□ -1.34
VID27P40157 YNL194CYNL194C 906 nt6.65□□□□□ -1.34
VID27P40157 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt6.65□□□□□ -1.34
VID27P40157 PGK1YCR012W 1251 nt6.64□□□□□ -1.35
VID27P40157 YGR022CYGR022C 330 nt6.64□□□□□ -1.35
VID27P40157 HAL1YPR005C 885 nt6.64□□□□□ -1.35
VID27P40157 POP1YNL221C 2628 nt6.64□□□□□ -1.35
VID27P40157 KEL1YHR158C 3495 nt6.64□□□□□ -1.35
VID27P40157 PAN6YIL145C 930 nt6.63□□□□□ -1.35
VID27P40157 CNE1YAL058W 1509 nt6.63□□□□□ -1.35
VID27P40157 PTR2YKR093W 1806 nt6.63□□□□□ -1.35
VID27P40157 LST8YNL006W 912 nt6.63□□□□□ -1.35
VID27P40157 ODC2YOR222W 924 nt6.63□□□□□ -1.35
VID27P40157 CDS1YBR029C 1374 nt6.63□□□□□ -1.35
VID27P40157 HOS1YPR068C 1413 nt6.63□□□□□ -1.35
VID27P40157 VRP1YLR337C 2454 nt6.62□□□□□ -1.35
VID27P40157 GEX2YKR106W 1848 nt6.62□□□□□ -1.35
VID27P40157 YML6YML025C 861 nt6.62□□□□□ -1.35
VID27P40157 YNR040WYNR040W 771 nt6.62□□□□□ -1.35
VID27P40157 PFK2YMR205C 2880 nt6.62□□□□□ -1.35
VID27P40157 GLE1YDL207W 1617 nt6.61□□□□□ -1.35
VID27P40157 AMD1YML035C 2433 nt6.61□□□□□ -1.35
VID27P40157 YHL017WYHL017W 1599 nt6.61□□□□□ -1.35
VID27P40157 RSA4YCR072C 1548 nt6.61□□□□□ -1.35
VID27P40157 YCL065WYCL065W 369 nt6.61□□□□□ -1.35
VID27P40157 GPI11YDR302W 660 nt6.61□□□□□ -1.35
VID27P40157 YGR127WYGR127W 939 nt6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms