Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL3RAP26951 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IL3RAP26951 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms