Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM2P07951 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM2P07951 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPM2P07951 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPM2P07951 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPM2P07951 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TPM2P07951 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TPM2P07951 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPM2P07951 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPM2P07951 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPM2P07951 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM2P07951 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM2P07951 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM2P07951 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM2P07951 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM2P07951 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM2P07951 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM2P07951 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM2P07951 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM2P07951 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM2P07951 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM2P07951 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM2P07951 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM2P07951 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM2P07951 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM2P07951 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM2P07951 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM2P07951 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM2P07951 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM2P07951 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM2P07951 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM2P07951 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM2P07951 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM2P07951 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM2P07951 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM2P07951 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM2P07951 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM2P07951 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM2P07951 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM2P07951 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM2P07951 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM2P07951 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM2P07951 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM2P07951 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM2P07951 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM2P07951 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM2P07951 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM2P07951 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPM2P07951 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPM2P07951 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPM2P07951 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPM2P07951 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM2P07951 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM2P07951 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM2P07951 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM2P07951 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM2P07951 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM2P07951 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM2P07951 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPM2P07951 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPM2P07951 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPM2P07951 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM2P07951 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM2P07951 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM2P07951 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM2P07951 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM2P07951 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM2P07951 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM2P07951 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM2P07951 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM2P07951 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM2P07951 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM2P07951 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM2P07951 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM2P07951 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM2P07951 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM2P07951 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM2P07951 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM2P07951 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM2P07951 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM2P07951 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM2P07951 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM2P07951 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM2P07951 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM2P07951 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM2P07951 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM2P07951 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM2P07951 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM2P07951 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM2P07951 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM2P07951 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms