Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK1P06493 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK1P06493 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK1P06493 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK1P06493 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK1P06493 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK1P06493 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK1P06493 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK1P06493 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK1P06493 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK1P06493 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK1P06493 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK1P06493 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK1P06493 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK1P06493 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK1P06493 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK1P06493 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK1P06493 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK1P06493 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK1P06493 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK1P06493 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK1P06493 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK1P06493 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK1P06493 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK1P06493 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK1P06493 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK1P06493 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK1P06493 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK1P06493 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK1P06493 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK1P06493 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK1P06493 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK1P06493 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK1P06493 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK1P06493 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK1P06493 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK1P06493 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK1P06493 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK1P06493 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK1P06493 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK1P06493 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK1P06493 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK1P06493 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK1P06493 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK1P06493 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK1P06493 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK1P06493 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK1P06493 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK1P06493 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK1P06493 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK1P06493 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK1P06493 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK1P06493 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK1P06493 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK1P06493 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK1P06493 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK1P06493 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK1P06493 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms