Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC17Q9NP64 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms