Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3BQ9H321 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCX3BQ9H321 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms