Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRFBP1Q8NEF9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFBP1Q8NEF9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms