Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM139Q8IV31 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM139Q8IV31 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms