Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 ATF5-203ENST00000596658 722 ntTSL 220.21■□□□□ 0.837e-9■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 THOP1-211ENST00000590970 1104 ntTSL 319.88■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 PLOD3-209ENST00000460475 746 ntTSL 319.73■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 LZTS2-204ENST00000429732 701 ntTSL 519.39■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-206ENST00000587832 791 ntTSL 219.2■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 PLOD3-203ENST00000421736 809 ntTSL 518.9■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SAMD4B-203ENST00000595476 710 ntTSL 318.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 THOP1-213ENST00000591363 639 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 LZTR1-204ENST00000415817 2323 ntTSL 318.38■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ATF5-204ENST00000597227 828 ntTSL 318.33■□□□□ 0.527e-9■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-212ENST00000590530 1871 ntTSL 218.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-203ENST00000585420 1730 ntTSL 218.27■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-213ENST00000590627 1051 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 LZTS2-203ENST00000426584 816 ntTSL 318.12■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-205ENST00000587072 453 ntTSL 518.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-217ENST00000534681 583 ntTSL 217.99■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 UQCRQ-206ENST00000498309 874 ntTSL 217.98■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.424e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 317.5■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MAN2C1-218ENST00000563794 818 ntTSL 317.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-208ENST00000588905 562 ntTSL 517.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-209ENST00000589039 523 ntTSL 517.02■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 C21orf58-208ENST00000472607 713 ntTSL 316.55■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-210ENST00000531880 845 ntTSL 316.5■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 DDA1-203ENST00000594501 398 ntTSL 216.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 C21orf58-206ENST00000417060 1072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 C21orf58-210ENST00000491666 1196 ntTSL 516.11■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-204ENST00000585760 475 ntTSL 216.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 FBRS-209ENST00000570170 1316 ntTSL 515.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.083e-9■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ATP5G3-205ENST00000497075 1313 ntTSL 214.88□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-206ENST00000527544 745 ntTSL 214.86□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-207ENST00000528198 609 ntTSL 414.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MAN2C1-228ENST00000565953 557 ntTSL 314.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ADGRL1-206ENST00000591528 612 ntTSL 214.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 DLG4-208ENST00000489885 1894 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MED24-209ENST00000491466 957 ntTSL 513.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SCAMP4-207ENST00000472442 2973 ntTSL 213.69□□□□□ -0.224e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 PCNX3-202ENST00000439247 3104 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-215ENST00000534293 559 ntTSL 312.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ZNF652-203ENST00000508237 4543 ntTSL 212.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 NCDN-204ENST00000423723 986 ntTSL 312.89□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KPNA1-203ENST00000465882 1062 ntTSL 312.81□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GSK3A-204ENST00000493059 761 ntTSL 212.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 LZTR1-209ENST00000463909 3505 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MAN2C1-215ENST00000563596 675 ntTSL 311.89□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 UQCRQ-202ENST00000378667 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 AC124798.1-201ENST00000568280 2883 ntBASIC10.71□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MSH5-218ENST00000494646 528 ntTSL 410.62□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KPNA1-206ENST00000476916 575 ntTSL 49□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 UQCRQ-205ENST00000496429 258 ntTSL 28.59□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KPNA1-202ENST00000464940 582 ntTSL 47.86□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 36.4
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