Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KARSQ15046 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KARSQ15046 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KARSQ15046 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KARSQ15046 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KARSQ15046 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KARSQ15046 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KARSQ15046 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KARSQ15046 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KARSQ15046 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KARSQ15046 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KARSQ15046 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KARSQ15046 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KARSQ15046 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KARSQ15046 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KARSQ15046 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KARSQ15046 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KARSQ15046 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KARSQ15046 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KARSQ15046 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KARSQ15046 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KARSQ15046 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KARSQ15046 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KARSQ15046 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KARSQ15046 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KARSQ15046 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KARSQ15046 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KARSQ15046 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KARSQ15046 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KARSQ15046 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KARSQ15046 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KARSQ15046 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KARSQ15046 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KARSQ15046 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KARSQ15046 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KARSQ15046 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KARSQ15046 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KARSQ15046 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KARSQ15046 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KARSQ15046 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KARSQ15046 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KARSQ15046 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KARSQ15046 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KARSQ15046 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KARSQ15046 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KARSQ15046 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KARSQ15046 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KARSQ15046 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KARSQ15046 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KARSQ15046 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KARSQ15046 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KARSQ15046 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KARSQ15046 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KARSQ15046 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KARSQ15046 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KARSQ15046 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KARSQ15046 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KARSQ15046 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KARSQ15046 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KARSQ15046 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KARSQ15046 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KARSQ15046 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KARSQ15046 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KARSQ15046 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KARSQ15046 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KARSQ15046 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KARSQ15046 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KARSQ15046 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KARSQ15046 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KARSQ15046 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KARSQ15046 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KARSQ15046 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KARSQ15046 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KARSQ15046 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KARSQ15046 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KARSQ15046 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KARSQ15046 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KARSQ15046 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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