Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 MPH3YJR160C 1809 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 YDR415CYDR415C 1125 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 HIS1YER055C 894 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YHL045WYHL045W 348 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 OPI8YKR035C 642 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YNL092WYNL092W 1203 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 IBD2YNL164C 1056 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 TOS6YNL300W 309 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 THI80YOR143C 960 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 FMP40YPL222W 2067 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 COX10YPL172C 1389 nt6.95□□□□□ -1.3 RIP-Chip
PUF3Q07807 YLH47YPR125W 1365 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 STT3YGL022W 2157 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 SGE1YPR198W 1632 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YCR016WYCR016W 873 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 GPD1YDL022W 1176 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 ERJ5YFR041C 888 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YJL144WYJL144W 315 nt6.95□□□□□ -1.3 RIP-Chip
PUF3Q07807 HCR1YLR192C 798 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 RRN10YBL025W 438 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 CYS4YGR155W 1524 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 EDE1YBL047C 4146 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 CTF18YMR078C 2226 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 SHO1YER118C 1104 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YPT1YFL038C 621 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 GEP7YGL057C 864 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 ARI1YGL157W 1044 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YKR032WYKR032W 315 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YLR407WYLR407W 687 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 CSM3YMR048W 954 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 CSG2YBR036C 1233 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YDR220CYDR220C 294 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 PIB1YDR313C 861 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 MRPL35YDR322W 1104 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 LSM6YDR378C 261 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 KSH1YNL024C-A 219 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 PUS4YNL292W 1212 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 RFC4YOL094C 972 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 CLP1YOR250C 1338 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YHK8YHR048W 1545 nt6.92□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 SHR3YDL212W 633 nt6.92□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 RPN9YDR427W 1182 nt6.92□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YGL235WYGL235W 537 nt6.92□□□□□ -1.3 RIP-Chip
PUF3Q07807 MIA40YKL195W 1212 nt6.92□□□□□ -1.3 RIP-Chip
PUF3Q07807 TVP38YKR088C 1014 nt6.92□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 MEU1YLR017W 1014 nt6.92□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 SMK1YPR054W 1167 nt6.92□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YPL245WYPL245W 1365 nt6.92□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 OMS1YDR316W 1416 nt6.92□□□□□ -1.3 RIP-Chip
PUF3Q07807 CDC16YKL022C 2523 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 HEM1YDR232W 1647 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YDR222WYDR222W 1248 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YGR291CYGR291C 222 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 WSS1YHR134W 810 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YKL077WYKL077W 1179 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YKL102CYKL102C 306 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 OST3YOR085W 1053 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 GPA1YHR005C 1419 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 CRH1YGR189C 1524 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 EDC3YEL015W 1656 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 ICL2YPR006C 1728 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 PRY3YJL078C 2646 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 DAL4YIR028W 1908 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 HSP12YFL014W 330 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 LST7YGR057C 729 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YRB2YIL063C 984 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 DCG1YIR030C 735 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YDC1YPL087W 954 nt6.9□□□□□ -1.3 RIP-Chip
PUF3Q07807 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 YBR226CYBR226C 411 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF3Q07807 RBS1YDL189W 1374 nt6.9□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 ASF1YJL115W 840 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YJR146WYJR146W 354 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YAR064WYAR064W 300 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 MRPL23YOR150W 492 nt6.89□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF3Q07807 DFR1YOR236W 636 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YBR113WYBR113W 483 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 CLD1YGR110W 1338 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 GFA1YKL104C 2154 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 ACO1YLR304C 2337 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 RGT2YDL138W 2292 nt6.88□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 ARO10YDR380W 1908 nt6.88□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF3Q07807 SUR7YML052W 909 nt6.88□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 LSC1YOR142W 990 nt6.88□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 TFB6YOR352W 1032 nt6.88□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 MIP1YOR330C 3765 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 VTS1YOR359W 1572 nt6.87□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF3Q07807 VAC17YCL063W 1272 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 EAF5YEL018W 840 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YFL019CYFL019C 354 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 LCL3YGL085W 825 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 FMO1YHR176W 1299 nt6.87□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF3Q07807 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 HYM1YKL189W 1200 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 SDS22YKL193C 1017 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 OGG1YML060W 1131 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 VPS68YOL129W 555 nt6.87□□□□□ -1.31
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