Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPAN13O95857 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms