Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3BQ9P1U1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1134 ms