Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BATF3Q9NR55 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 618.2 ms