Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP9Q8TA86 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms