Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C17orf53Q8N3J3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C17orf53Q8N3J3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms