Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PERM1Q5SV97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms