Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PEX6Q13608 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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