Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIGQ13278 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIGQ13278 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIGQ13278 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIGQ13278 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIGQ13278 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIGQ13278 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIGQ13278 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIGQ13278 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIGQ13278 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIGQ13278 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIGQ13278 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIGQ13278 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIGQ13278 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIGQ13278 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIGQ13278 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIGQ13278 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIGQ13278 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIGQ13278 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIGQ13278 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIGQ13278 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIGQ13278 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIGQ13278 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIGQ13278 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIGQ13278 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIGQ13278 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIGQ13278 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIGQ13278 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIGQ13278 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIGQ13278 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIGQ13278 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIGQ13278 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIGQ13278 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIGQ13278 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIGQ13278 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIGQ13278 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIGQ13278 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIGQ13278 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIGQ13278 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIGQ13278 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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