Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 RRP46YGR095C 672 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF8Q12483 TDH2YJR009C 999 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF8Q12483 MDH1YKL085W 1005 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF8Q12483 SCS7YMR272C 1155 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF8Q12483 YPR123CYPR123C 435 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF8Q12483 YLL067CYLL067C 3618 nt5.84□□□□□ -1.47
SNF8Q12483 YDR514CYDR514C 1452 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 YET3YDL072C 612 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 CDC34YDR054C 888 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 THI4YGR144W 981 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 PSR2YLR019W 1194 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 RRS1YOR294W 612 nt5.83□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 KKQ8YKL168C 2175 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 GDA1YEL042W 1557 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 MAK31YCR020C-A 267 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 YHL018WYHL018W 363 nt5.82□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 JIP4YDR475C 2631 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 STB5YHR178W 2232 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 RPT3YDR394W 1287 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 YEL068CYEL068C 333 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 MRS1YIR021W 1092 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 IDP3YNL009W 1263 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 TSR3YOR006C 942 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 MDM31YHR194W 1740 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 YBR284WYBR284W 2394 nt5.81□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 MNN5YJL186W 1761 nt5.8□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 BCY1YIL033C 1251 nt5.8□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 TSA1YML028W 591 nt5.8□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 YOL163WYOL163W 510 nt5.8□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 FRS2YFL022C 1512 nt5.79□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 HST3YOR025W 1344 nt5.79□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 CHS5YLR330W 2016 nt5.79□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 ERG1YGR175C 1491 nt5.79□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 HVG1YER039C 750 nt5.79□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 RRP9YPR137W 1722 nt5.79□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 RGD1YBR260C 2001 nt5.79□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 RPN11YFR004W 921 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 LDS1YAL018C 978 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 YML018CYML018C 1182 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 YMR295CYMR295C 594 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 MRPL10YNL284C 969 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 YNL285WYNL285W 372 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 MRPS16YPL013C 366 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 GLN1YPR035W 1113 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 YPR114WYPR114W 948 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 GAA1YLR088W 1845 nt5.78□□□□□ -1.48
SNF8Q12483 CSC1YLR241W 2349 nt5.77□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SNU71YGR013W 1863 nt5.77□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.77□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YIL077CYIL077C 963 nt5.77□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YHM2YMR241W 945 nt5.77□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 IFA38YBR159W 1044 nt5.77□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SPS22YCL048W 1392 nt5.77□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 ICL1YER065C 1674 nt5.76□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 PYK2YOR347C 1521 nt5.76□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.76□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 OAC1YKL120W 975 nt5.76□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YLR463CYLR463C 552 nt5.76□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YFL052WYFL052W 1398 nt5.76□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 VPS5YOR069W 2028 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YEL020CYEL020C 1683 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 MAK32YCR019W 1092 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 snR82snR82 268 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YDR015CYDR015C 240 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 RPE1YJL121C 717 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 MRPS12YNR036C 462 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 CMR1YDL156W 1569 nt5.75□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 VPS4YPR173C 1314 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 DSF1YEL070W 1509 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YNR073CYNR073C 1509 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 BUD9YGR041W 1644 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 JNM1YMR294W 1122 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 CAF40YNL288W 1122 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 CYC8YBR112C 2901 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 PCS60YBR222C 1632 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 DUG1YFR044C 1446 nt5.74□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YNR040WYNR040W 771 nt5.73□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YIL055CYIL055C 1884 nt5.73□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 ATG4YNL223W 1485 nt5.72□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 YDL218WYDL218W 954 nt5.72□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 CDC11YJR076C 1248 nt5.72□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 VMA4YOR332W 702 nt5.72□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 SUB2YDL084W 1341 nt5.72□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 MSS1YMR023C 1581 nt5.72□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 RAD3YER171W 2337 nt5.71□□□□□ -1.49
SNF8Q12483 HIR1YBL008W 2523 nt5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.3 ms