Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC24CP53992 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms