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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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317 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
YKR032W
YKR032W
315 nt
6.79
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
YLR412C-A
YLR412C-A
207 nt
6.79
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
RRN10
YBL025W
438 nt
6.79
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
ADH5
YBR145W
1056 nt
6.79
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
FET4
YMR319C
1659 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
BIO3
YNR058W
1443 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
HMLALPHA1
YCL066W
528 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
MATALPHA1
YCR040W
528 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
TRR1
YDR353W
960 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
DYS1
YHR068W
1164 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
YJR107W
YJR107W
987 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
MEU1
YLR017W
1014 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
SNN1
YNL086W
309 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
MFA2
YNL145W
117 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
DAP1
YPL170W
459 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
BNA5
YLR231C
1362 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
COX10
YPL172C
1389 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
DOT1
YDR440W
1749 nt
6.78
□□□□□ -1.32
RTA1
P53047
PLB3
YOL011W
2061 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
NFI1
YOR156C
2181 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
SEC18
YBR080C
2277 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
PHM8
YER037W
966 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YJL144W
YJL144W
315 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
KRE9
YJL174W
831 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
LIA1
YJR070C
978 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
TOS6
YNL300W
309 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
SMK1
YPR054W
1167 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
MPC54
YOR177C
1395 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
HEL1
YKR017C
1656 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
EDE1
YBL047C
4146 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YOR389W
YOR389W
1875 nt
6.77
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
STT3
YGL022W
2157 nt
6.76
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
UPS3
YDR185C
540 nt
6.76
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YDR541C
YDR541C
1035 nt
6.76
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
MED6
YHR058C
888 nt
6.76
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YLL017W
YLL017W
312 nt
6.76
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YOL035C
YOL035C
303 nt
6.76
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
MPH3
YJR160C
1809 nt
6.76
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
FMP40
YPL222W
2067 nt
6.75
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
SSC1
YJR045C
1965 nt
6.75
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YPT1
YFL038C
621 nt
6.75
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
NCS6
YGL211W
1080 nt
6.75
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
MIA40
YKL195W
1212 nt
6.75
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YNL092W
YNL092W
1203 nt
6.75
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
RFC4
YOL094C
972 nt
6.75
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
RPO26
YPR187W
468 nt
6.75
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YHK8
YHR048W
1545 nt
6.75
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
GPD1
YDL022W
1176 nt
6.74
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
LSM6
YDR378C
261 nt
6.74
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
SED5
YLR026C
1023 nt
6.74
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
KSH1
YNL024C-A
219 nt
6.74
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
RAD17
YOR368W
1206 nt
6.74
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
AIM3
YBR108W
2844 nt
6.74
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
CMK2
YOL016C
1344 nt
6.74
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
SRV2
YNL138W
1581 nt
6.74
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
HEM1
YDR232W
1647 nt
6.73
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
CYS4
YGR155W
1524 nt
6.73
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YUR1
YJL139C
1287 nt
6.73
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
OMA1
YKR087C
1038 nt
6.73
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
SUR7
YML052W
909 nt
6.73
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
SCP1
YOR367W
603 nt
6.73
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
HSP12
YFL014W
330 nt
6.72
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YKL077W
YKL077W
1179 nt
6.72
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
OSW5
YMR148W
447 nt
6.72
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
MTF1
YMR228W
1026 nt
6.72
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YPL250W-A
YPL250W-A
288 nt
6.72
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
UBA3
YPR066W
900 nt
6.72
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
YBR113W
YBR113W
483 nt
6.72
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
CRF1
YDR223W
1404 nt
6.72
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
NMD5
YJR132W
3147 nt
6.72
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
ARO9
YHR137W
1542 nt
6.71
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
ARP3
YJR065C
1350 nt
6.71
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
PRP46
YPL151C
1356 nt
6.71
□□□□□ -1.33
RTA1
P53047
MIP1
YOR330C
3765 nt
6.71
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
MRPL35
YDR322W
1104 nt
6.71
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
YRB2
YIL063C
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6.71
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
ASF1
YJL115W
840 nt
6.71
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
YJR146W
YJR146W
354 nt
6.71
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RTA1
P53047
YKL102C
YKL102C
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RTA1
P53047
PUS4
YNL292W
1212 nt
6.71
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
CRH1
YGR189C
1524 nt
6.71
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
CDC34
YDR054C
888 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
MCM21
YDR318W
1107 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
SUF5
tG(CCC)O
72 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
YHR213W-B
YHR213W-B
300 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
OAC1
YKL120W
975 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
YAR064W
YAR064W
300 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
NMD4
YLR363C
657 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
YLR402W
YLR402W
192 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
YOL050C
YOL050C
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6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
MRPL23
YOR150W
492 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
SRP101
YDR292C
1866 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
PRY3
YJL078C
2646 nt
6.7
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
FMO1
YHR176W
1299 nt
6.69
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
FBA1
YKL060C
1080 nt
6.69
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
YLR283W
YLR283W
945 nt
6.69
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
TSR3
YOR006C
942 nt
6.69
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
OAZ1
YPL052W
879 nt
6.69
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
VHS1
YDR247W
1386 nt
6.69
□□□□□ -1.34
RTA1
P53047
MIF2
YKL089W
1650 nt
6.68
□□□□□ -1.34
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