Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 ENP1YBR247C 1452 nt6.63□□□□□ -1.35
VFA1P40080 CNE1YAL058W 1509 nt6.62□□□□□ -1.35
VFA1P40080 PMP3YDR276C 168 nt6.62□□□□□ -1.35
VFA1P40080 RPT3YDR394W 1287 nt6.62□□□□□ -1.35
VFA1P40080 TDH2YJR009C 999 nt6.62□□□□□ -1.35
VFA1P40080 GLN1YPR035W 1113 nt6.62□□□□□ -1.35
VFA1P40080 OPI7YDR360W 435 nt6.61□□□□□ -1.35
VFA1P40080 MSP1YGR028W 1089 nt6.61□□□□□ -1.35
VFA1P40080 YPL071CYPL071C 471 nt6.61□□□□□ -1.35
VFA1P40080 YPR123CYPR123C 435 nt6.61□□□□□ -1.35
VFA1P40080 HST3YOR025W 1344 nt6.6□□□□□ -1.35
VFA1P40080 YET3YDL072C 612 nt6.6□□□□□ -1.35
VFA1P40080 CDC34YDR054C 888 nt6.6□□□□□ -1.35
VFA1P40080 TFG2YGR005C 1203 nt6.6□□□□□ -1.35
VFA1P40080 HMS2YJR147W 1077 nt6.6□□□□□ -1.35
VFA1P40080 DPH5YLR172C 903 nt6.6□□□□□ -1.35
VFA1P40080 YOL163WYOL163W 510 nt6.6□□□□□ -1.35
VFA1P40080 STB5YHR178W 2232 nt6.6□□□□□ -1.35
VFA1P40080 RIO1YOR119C 1455 nt6.6□□□□□ -1.35
VFA1P40080 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 BCY1YIL033C 1251 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 DRE2YKR071C 1047 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 TSA1YML028W 591 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 KKQ8YKL168C 2175 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 MNN5YJL186W 1761 nt6.59□□□□□ -1.35
VFA1P40080 YDR514CYDR514C 1452 nt6.59□□□□□ -1.36
VFA1P40080 MAK31YCR020C-A 267 nt6.58□□□□□ -1.36
VFA1P40080 SCS7YMR272C 1155 nt6.58□□□□□ -1.36
VFA1P40080 MDM31YHR194W 1740 nt6.58□□□□□ -1.36
VFA1P40080 APM1YPL259C 1428 nt6.58□□□□□ -1.36
VFA1P40080 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.57□□□□□ -1.36
VFA1P40080 LDS1YAL018C 978 nt6.57□□□□□ -1.36
VFA1P40080 YMR295CYMR295C 594 nt6.57□□□□□ -1.36
VFA1P40080 NOG2YNR053C 1461 nt6.56□□□□□ -1.36
VFA1P40080 HVG1YER039C 750 nt6.56□□□□□ -1.36
VFA1P40080 YHL018WYHL018W 363 nt6.56□□□□□ -1.36
VFA1P40080 YHR140WYHR140W 720 nt6.56□□□□□ -1.36
VFA1P40080 ERG1YGR175C 1491 nt6.55□□□□□ -1.36
VFA1P40080 YEL068CYEL068C 333 nt6.55□□□□□ -1.36
VFA1P40080 MRS1YIR021W 1092 nt6.55□□□□□ -1.36
VFA1P40080 MRPS12YNR036C 462 nt6.55□□□□□ -1.36
VFA1P40080 TSR3YOR006C 942 nt6.55□□□□□ -1.36
VFA1P40080 YPR114WYPR114W 948 nt6.55□□□□□ -1.36
VFA1P40080 RRP9YPR137W 1722 nt6.55□□□□□ -1.36
VFA1P40080 FRS2YFL022C 1512 nt6.55□□□□□ -1.36
VFA1P40080 PKC1YBL105C 3456 nt6.55□□□□□ -1.36
VFA1P40080 FRE5YOR384W 2085 nt6.54□□□□□ -1.36
VFA1P40080 GYP8YFL027C 1494 nt6.54□□□□□ -1.36
VFA1P40080 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.54□□□□□ -1.36
VFA1P40080 HST2YPL015C 1074 nt6.54□□□□□ -1.36
VFA1P40080 IFA38YBR159W 1044 nt6.54□□□□□ -1.36
VFA1P40080 MCM3YEL032W 2916 nt6.54□□□□□ -1.36
VFA1P40080 PYK2YOR347C 1521 nt6.54□□□□□ -1.36
VFA1P40080 NTE1YML059C 5040 nt6.53□□□□□ -1.36
VFA1P40080 DAL7YIR031C 1665 nt6.53□□□□□ -1.36
VFA1P40080 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.53□□□□□ -1.36
VFA1P40080 PHB1YGR132C 864 nt6.53□□□□□ -1.36
VFA1P40080 VMA4YOR332W 702 nt6.53□□□□□ -1.36
VFA1P40080 MRPS16YPL013C 366 nt6.53□□□□□ -1.36
VFA1P40080 MRC1YCL061C 3291 nt6.52□□□□□ -1.37
VFA1P40080 CDC10YCR002C 969 nt6.52□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YDR015CYDR015C 240 nt6.52□□□□□ -1.37
VFA1P40080 CAF40YNL288W 1122 nt6.52□□□□□ -1.37
VFA1P40080 CDS1YBR029C 1374 nt6.52□□□□□ -1.37
VFA1P40080 ICL1YER065C 1674 nt6.52□□□□□ -1.37
VFA1P40080 VPS4YPR173C 1314 nt6.51□□□□□ -1.37
VFA1P40080 KEL1YHR158C 3495 nt6.51□□□□□ -1.37
VFA1P40080 TRP1YDR007W 675 nt6.51□□□□□ -1.37
VFA1P40080 RPN11YFR004W 921 nt6.51□□□□□ -1.37
VFA1P40080 RPE1YJL121C 717 nt6.51□□□□□ -1.37
VFA1P40080 TPK1YJL164C 1194 nt6.51□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YML018CYML018C 1182 nt6.51□□□□□ -1.37
VFA1P40080 ATG4YNL223W 1485 nt6.51□□□□□ -1.37
VFA1P40080 DSF1YEL070W 1509 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YNR073CYNR073C 1509 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 SRY1YKL218C 981 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YLR463CYLR463C 552 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 HAP3YBL021C 435 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 JNM1YMR294W 1122 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 CWC25YNL245C 540 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 MRPL10YNL284C 969 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YNL285WYNL285W 372 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YPL136WYPL136W 369 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 VPS5YOR069W 2028 nt6.5□□□□□ -1.37
VFA1P40080 DPB2YPR175W 2070 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YLL067CYLL067C 3618 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 GUT1YHL032C 2130 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 RGD1YBR260C 2001 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YDL218WYDL218W 954 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.2 ms