Protein–RNA interactions for Protein: P35995

YKL222C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YKL222C, yeastyeast

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL222CP35995 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.38□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.38□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.38□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.38□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.38□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.38□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.38□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 ARC19YKL013C 516 nt7.38□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 AGP2YBR132C 1791 nt7.38□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 PUF3YLL013C 2640 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 COR1YBL045C 1374 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 EDE1YBL047C 4146 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 BNA3YJL060W 1335 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 GAA1YLR088W 1845 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 YER137CYER137C 447 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 MIA40YKL195W 1212 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 UBC12YLR306W 567 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 CIN4YMR138W 576 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 DFR1YOR236W 636 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 ICL2YPR006C 1728 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 JIP4YDR475C 2631 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 CMR1YDL156W 1569 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 PPS1YBR276C 2424 nt7.37□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 RSM23YGL129C 1353 nt7.36□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 NPL6YMR091C 1308 nt7.36□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 YHP1YDR451C 1062 nt7.36□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt7.36□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 MRPL36YBR122C 534 nt7.36□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 PRI2YKL045W 1587 nt7.36□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 YFL052WYFL052W 1398 nt7.35□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt7.35□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 ARP2YDL029W 1176 nt7.35□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 MRPL28YDR462W 444 nt7.35□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 LDS1YAL018C 978 nt7.35□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 YML012C-AYML012C-A 378 nt7.35□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 ATG12YBR217W 561 nt7.35□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 MRK1YDL079C 1506 nt7.35□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 TRR1YDR353W 960 nt7.34□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 EFM4YIL064W 774 nt7.34□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 PEX13YLR191W 1161 nt7.34□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 VPS28YPL065W 729 nt7.34□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 MRPS5YBR251W 924 nt7.34□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 NMD5YJR132W 3147 nt7.34□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 AMD2YDR242W 1650 nt7.34□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 ACO1YLR304C 2337 nt7.34□□□□□ -1.23
YKL222CP35995 YOR389WYOR389W 1875 nt7.33□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 YGL118CYGL118C 438 nt7.33□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 SYN8YAL014C 768 nt7.33□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 MRP17YKL003C 396 nt7.33□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 AIM33YML087C 939 nt7.33□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 FAR3YMR052W 615 nt7.33□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt7.33□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 ILV1YER086W 1731 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 HEM1YDR232W 1647 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 YMR155WYMR155W 1644 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 PIC2YER053C 903 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 MPC1YGL080W 393 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 FZF1YGL254W 900 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 YNL120CYNL120C 486 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 ARG1YOL058W 1263 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 CAR1YPL111W 1002 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 SNT309YPR101W 528 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 TPO3YPR156C 1869 nt7.32□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 ENP1YBR247C 1452 nt7.31□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 IME2YJL106W 1938 nt7.31□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 RRP45YDR280W 918 nt7.31□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 LOT6YLR011W 576 nt7.31□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 AAD15YOL165C 432 nt7.31□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 SSO1YPL232W 873 nt7.31□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 GEF1YJR040W 2340 nt7.3□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 YGR022CYGR022C 330 nt7.3□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 COX3Q0275 810 nt7.3□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 PZF1YPR186C 1290 nt7.3□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 VTS1YOR359W 1572 nt7.29□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 ADE13YLR359W 1449 nt7.29□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 MLC1YGL106W 450 nt7.29□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 SFC1YJR095W 969 nt7.29□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 ERG3YLR056W 1098 nt7.29□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 YFR006WYFR006W 1608 nt7.29□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 YKR018CYKR018C 2178 nt7.29□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 PAP2YOL115W 1755 nt7.28□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 TOS2YGR221C 1869 nt7.28□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 MDH3YDL078C 1032 nt7.28□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 CCP1YKR066C 1086 nt7.28□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.28□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.28□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.28□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.28□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 NTE1YML059C 5040 nt7.27□□□□□ -1.24
YKL222CP35995 COX20YDR231C 618 nt7.27□□□□□ -1.25
YKL222CP35995 LEU5YHR002W 1074 nt7.27□□□□□ -1.25
YKL222CP35995 YLR311CYLR311C 348 nt7.27□□□□□ -1.25
YKL222CP35995 SWP1YMR149W 861 nt7.27□□□□□ -1.25
YKL222CP35995 YCR041WYCR041W 333 nt7.26□□□□□ -1.25
YKL222CP35995 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.26□□□□□ -1.25
YKL222CP35995 YHR145CYHR145C 357 nt7.26□□□□□ -1.25
YKL222CP35995 GCN3YKR026C 918 nt7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms