Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 MDE1YJR024C 735 nt5.31□□□□□ -1.56
MSK1P32048 YBR027CYBR027C 333 nt5.31□□□□□ -1.56
MSK1P32048 ECM2YBR065C 1095 nt5.31□□□□□ -1.56
MSK1P32048 ATG18YFR021W 1503 nt5.31□□□□□ -1.56
MSK1P32048 MRP1YDR347W 966 nt5.3□□□□□ -1.56
MSK1P32048 VMA4YOR332W 702 nt5.3□□□□□ -1.56
MSK1P32048 MRP51YPL118W 1035 nt5.3□□□□□ -1.56
MSK1P32048 HRQ1YDR291W 3234 nt5.3□□□□□ -1.56
MSK1P32048 LAT1YNL071W 1449 nt5.3□□□□□ -1.56
MSK1P32048 GPA2YER020W 1350 nt5.29□□□□□ -1.56
MSK1P32048 TEP1YNL128W 1305 nt5.29□□□□□ -1.56
MSK1P32048 MKK2YPL140C 1521 nt5.29□□□□□ -1.56
MSK1P32048 TRP5YGL026C 2124 nt5.29□□□□□ -1.56
MSK1P32048 RPE1YJL121C 717 nt5.29□□□□□ -1.56
MSK1P32048 PDA1YER178W 1263 nt5.28□□□□□ -1.56
MSK1P32048 YGL235WYGL235W 537 nt5.28□□□□□ -1.56
MSK1P32048 GUS1YGL245W 2127 nt5.28□□□□□ -1.56
MSK1P32048 POP5YAL033W 522 nt5.28□□□□□ -1.56
MSK1P32048 RUF23RUF23 254 nt5.28□□□□□ -1.56
MSK1P32048 RDL1YOR285W 420 nt5.28□□□□□ -1.56
MSK1P32048 GLN1YPR035W 1113 nt5.28□□□□□ -1.56
MSK1P32048 AVO1YOL078W 3531 nt5.28□□□□□ -1.56
MSK1P32048 TNA1YGR260W 1605 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YGR054WYGR054W 1929 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 ADK2YER170W 678 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 NUP49YGL172W 1419 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YHR140WYHR140W 720 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 MEH1YKR007W 555 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 GEP5YLR091W 882 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YNL108CYNL108C 813 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 IFA38YBR159W 1044 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YHK8YHR048W 1545 nt5.27□□□□□ -1.57
MSK1P32048 TRP1YDR007W 675 nt5.26□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.26□□□□□ -1.57
MSK1P32048 PUP1YOR157C 786 nt5.26□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YPL067CYPL067C 597 nt5.26□□□□□ -1.57
MSK1P32048 DAP1YPL170W 459 nt5.26□□□□□ -1.57
MSK1P32048 snR30snR30 606 nt5.26□□□□□ -1.57
MSK1P32048 ECM31YBR176W 939 nt5.26□□□□□ -1.57
MSK1P32048 MKC7YDR144C 1791 nt5.26□□□□□ -1.57
MSK1P32048 GPB2YAL056W 2643 nt5.26□□□□□ -1.57
MSK1P32048 TIM22YDL217C 624 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 TMT1YER175C 900 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 ERP5YHR110W 639 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 LYS1YIR034C 1122 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YKL077WYKL077W 1179 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 COX17YLL009C 210 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 MRPL23YOR150W 492 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 VPS70YJR126C 2436 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 SFB3YHR098C 2790 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 HSP104YLL026W 2727 nt5.25□□□□□ -1.57
MSK1P32048 TEL2YGR099W 2067 nt5.24□□□□□ -1.57
MSK1P32048 CDC10YCR002C 969 nt5.24□□□□□ -1.57
MSK1P32048 FUS3YBL016W 1062 nt5.24□□□□□ -1.57
MSK1P32048 SLG1YOR008C 1137 nt5.24□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YMC1YPR058W 924 nt5.24□□□□□ -1.57
MSK1P32048 PDB1YBR221C 1101 nt5.24□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YMR279CYMR279C 1623 nt5.23□□□□□ -1.57
MSK1P32048 GEX2YKR106W 1848 nt5.23□□□□□ -1.57
MSK1P32048 PYC2YBR218C 3543 nt5.23□□□□□ -1.57
MSK1P32048 RHO4YKR055W 876 nt5.23□□□□□ -1.57
MSK1P32048 RPL10YLR075W 666 nt5.23□□□□□ -1.57
MSK1P32048 MCH1YDL054C 1461 nt5.23□□□□□ -1.57
MSK1P32048 HIR1YBL008W 2523 nt5.23□□□□□ -1.57
MSK1P32048 EPS1YIL005W 2106 nt5.23□□□□□ -1.57
MSK1P32048 STE13YOR219C 2796 nt5.22□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YRB2YIL063C 984 nt5.22□□□□□ -1.57
MSK1P32048 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.22□□□□□ -1.57
MSK1P32048 SCO2YBR024W 906 nt5.22□□□□□ -1.57
MSK1P32048 CPA1YOR303W 1236 nt5.22□□□□□ -1.57
MSK1P32048 HAL1YPR005C 885 nt5.22□□□□□ -1.57
MSK1P32048 FET3YMR058W 1911 nt5.22□□□□□ -1.57
MSK1P32048 SET5YHR207C 1581 nt5.21□□□□□ -1.57
MSK1P32048 CRZ1YNL027W 2037 nt5.21□□□□□ -1.57
MSK1P32048 TKL1YPR074C 2043 nt5.21□□□□□ -1.57
MSK1P32048 CHO1YER026C 831 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 TRR2YHR106W 1029 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 YKL223WYKL223W 333 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 YLR358CYLR358C 564 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 SEC17YBL050W 879 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 PRS4YBL068W 981 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 YOL131WYOL131W 327 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 XBP1YIL101C 1944 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 ARE2YNR019W 1929 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 GIT1YCR098C 1557 nt5.21□□□□□ -1.58
MSK1P32048 RCK1YGL158W 1539 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 RPT3YDR394W 1287 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 PIH1YHR034C 1035 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 PTH2YBL057C 627 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 ODC2YOR222W 924 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 GUA1YMR217W 1578 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 EXG1YLR300W 1347 nt5.2□□□□□ -1.58
MSK1P32048 GAT1YFL021W 1533 nt5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.1 ms