Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALRP27797 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALRP27797 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALRP27797 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALRP27797 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALRP27797 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALRP27797 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALRP27797 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALRP27797 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALRP27797 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALRP27797 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALRP27797 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALRP27797 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALRP27797 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALRP27797 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALRP27797 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALRP27797 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALRP27797 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALRP27797 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALRP27797 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALRP27797 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALRP27797 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALRP27797 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALRP27797 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALRP27797 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALRP27797 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALRP27797 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALRP27797 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALRP27797 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALRP27797 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALRP27797 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALRP27797 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALRP27797 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALRP27797 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALRP27797 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALRP27797 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALRP27797 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALRP27797 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALRP27797 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALRP27797 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALRP27797 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALRP27797 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALRP27797 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALRP27797 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALRP27797 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALRP27797 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALRP27797 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALRP27797 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALRP27797 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALRP27797 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALRP27797 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALRP27797 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALRP27797 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALRP27797 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALRP27797 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALRP27797 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALRP27797 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALRP27797 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALRP27797 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALRP27797 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALRP27797 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALRP27797 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CALRP27797 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALRP27797 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALRP27797 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALRP27797 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALRP27797 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALRP27797 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms