Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCSHP23434 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCSHP23434 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCSHP23434 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCSHP23434 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCSHP23434 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCSHP23434 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCSHP23434 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCSHP23434 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCSHP23434 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCSHP23434 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCSHP23434 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCSHP23434 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCSHP23434 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCSHP23434 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCSHP23434 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCSHP23434 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCSHP23434 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCSHP23434 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCSHP23434 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCSHP23434 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCSHP23434 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCSHP23434 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCSHP23434 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCSHP23434 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCSHP23434 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCSHP23434 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCSHP23434 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCSHP23434 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCSHP23434 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCSHP23434 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCSHP23434 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCSHP23434 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCSHP23434 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCSHP23434 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms