Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WXM4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms