Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMT12Q53H54 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms