Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOSQ9BQE4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOSQ9BQE4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOSQ9BQE4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms