Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC2Q92769 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC2Q92769 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms