Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCN1Q92616 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCN1Q92616 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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GCN1Q92616 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCN1Q92616 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCN1Q92616 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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GCN1Q92616 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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GCN1Q92616 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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GCN1Q92616 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCN1Q92616 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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GCN1Q92616 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCN1Q92616 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCN1Q92616 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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GCN1Q92616 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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GCN1Q92616 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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GCN1Q92616 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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GCN1Q92616 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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GCN1Q92616 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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GCN1Q92616 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCN1Q92616 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GCN1Q92616 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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GCN1Q92616 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCN1Q92616 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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