Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSL3Q8N5Y2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSL3Q8N5Y2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSL3Q8N5Y2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms