Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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