Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD47Q08722 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD47Q08722 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD47Q08722 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD47Q08722 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD47Q08722 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD47Q08722 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD47Q08722 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD47Q08722 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD47Q08722 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD47Q08722 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD47Q08722 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD47Q08722 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD47Q08722 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD47Q08722 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD47Q08722 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD47Q08722 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD47Q08722 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD47Q08722 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD47Q08722 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD47Q08722 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD47Q08722 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD47Q08722 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD47Q08722 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD47Q08722 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD47Q08722 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD47Q08722 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD47Q08722 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD47Q08722 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD47Q08722 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD47Q08722 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD47Q08722 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD47Q08722 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD47Q08722 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD47Q08722 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD47Q08722 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD47Q08722 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD47Q08722 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD47Q08722 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD47Q08722 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD47Q08722 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD47Q08722 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD47Q08722 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD47Q08722 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD47Q08722 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD47Q08722 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD47Q08722 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD47Q08722 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD47Q08722 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD47Q08722 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD47Q08722 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD47Q08722 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD47Q08722 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD47Q08722 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD47Q08722 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD47Q08722 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD47Q08722 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD47Q08722 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD47Q08722 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD47Q08722 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms