Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 MDH2YOL126C 1134 nt7.26□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 CHS5YLR330W 2016 nt7.26□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 RUP1YOR138C 2016 nt7.25□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 BIM1YER016W 1035 nt7.25□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 PSR2YLR019W 1194 nt7.25□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 PPA2YMR267W 933 nt7.25□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 IRC11YOR013W 471 nt7.25□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 RSC9YML127W 1746 nt7.24□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 GUS1YGL245W 2127 nt7.24□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 HER2YMR293C 1395 nt7.24□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 snR57snR57 88 nt7.24□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 YDR509WYDR509W 348 nt7.24□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 GCV3YAL044C 513 nt7.24□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 RPL31BYLR406C 342 nt7.24□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 CTF19YPL018W 1110 nt7.24□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt7.23□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 YLR283WYLR283W 945 nt7.23□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 TCB1YOR086C 3561 nt7.23□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 CTA1YDR256C 1548 nt7.22□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 SPT3YDR392W 1014 nt7.22□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 RPN11YFR004W 921 nt7.22□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 BUD32YGR262C 786 nt7.22□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 DOT5YIL010W 648 nt7.22□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 VTA1YLR181C 993 nt7.22□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 LAG2YOL025W 1983 nt7.22□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 YLL066CYLL066C 3618 nt7.21□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 YLL067CYLL067C 3618 nt7.21□□□□□ -1.25
YLR225CQ05948 RAM1YDL090C 1296 nt7.21□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YJR056CYJR056C 711 nt7.21□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 SPC42YKL042W 1092 nt7.21□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 OMA1YKR087C 1038 nt7.21□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 LIP5YOR196C 1245 nt7.21□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 ARH1YDR376W 1482 nt7.21□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 BPL1YDL141W 2073 nt7.21□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 MHP1YJL042W 4197 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 MAF1YDR005C 1188 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YEA6YEL006W 1008 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 ADD66YKL206C 804 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 POS5YPL188W 1245 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 GCD11YER025W 1584 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YBL113CYBL113C 2379 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 PTC3YBL056W 1407 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 RVB2YPL235W 1416 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 CTF18YMR078C 2226 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YLR036CYLR036C 612 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YLR126CYLR126C 756 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YLR311CYLR311C 348 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 NMD4YLR363C 657 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 SPS22YCL048W 1392 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 PCL9YDL179W 915 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YDL218WYDL218W 954 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 MRPL25YGR076C 474 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 RRT7YLL030C 342 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 MET30YIL046W 1923 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YMR034CYMR034C 1305 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 RCK1YGL158W 1539 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 SRG1SRG1 551 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YNL228WYNL228W 777 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 HEM15YOR176W 1182 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 FCP1YMR277W 2199 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YDR132CYDR132C 1488 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 PPT1YGR123C 1542 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 STF1YDL130W-A 261 nt7.16□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YGR066CYGR066C 879 nt7.16□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 PHO85YPL031C 918 nt7.16□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 ATP4YPL078C 735 nt7.16□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 HAL1YPR005C 885 nt7.16□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 COX10YPL172C 1389 nt7.16□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 RGT2YDL138W 2292 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 AAT2YLR027C 1257 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 KSH1YNL024C-A 219 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 YPR127WYPR127W 1038 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR225CQ05948 SPO77YLR341W 1434 nt7.15□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 ATG18YFR021W 1503 nt7.15□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 PMT2YAL023C 2280 nt7.14□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 PEX22YAL055W 543 nt7.14□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 YNL190WYNL190W 615 nt7.14□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 SKS1YPL026C 1509 nt7.14□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 PMT7YDR307W 1989 nt7.13□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 ECM10YEL030W 1935 nt7.13□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 COQ1YBR003W 1422 nt7.13□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 SDH4YDR178W 546 nt7.13□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 PCL6YER059W 1263 nt7.13□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 HEM2YGL040C 1029 nt7.13□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 ASK1YKL052C 879 nt7.13□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 ODC2YOR222W 924 nt7.13□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 AME1YBR211C 975 nt7.13□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 YEF1YEL041W 1488 nt7.12□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 YDL129WYDL129W 876 nt7.12□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 YDR015CYDR015C 240 nt7.12□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 GAT4YIR013C 366 nt7.11□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 LYS1YIR034C 1122 nt7.11□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 YGP1YNL160W 1065 nt7.11□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 RRP40YOL142W 723 nt7.11□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 CMR1YDL156W 1569 nt7.11□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 CDC19YAL038W 1503 nt7.11□□□□□ -1.27
YLR225CQ05948 PTR2YKR093W 1806 nt7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 83.8 ms