Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 YBL112CYBL112C 318 nt5.99□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 DAP1YPL170W 459 nt5.99□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 EXG1YLR300W 1347 nt5.99□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 CYC8YBR112C 2901 nt5.98□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 PDR18YNR070W 4002 nt5.98□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 CEF1YMR213W 1773 nt5.98□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 RAP1YNL216W 2484 nt5.98□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 RAD59YDL059C 717 nt5.98□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 YJR084WYJR084W 1272 nt5.98□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 RIX7YLL034C 2514 nt5.97□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 ILV1YER086W 1731 nt5.97□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 YCK1YHR135C 1617 nt5.97□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 SDH4YDR178W 546 nt5.97□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 ERP2YAL007C 648 nt5.97□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 YMR252CYMR252C 405 nt5.97□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 YOR111WYOR111W 699 nt5.97□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 TAE1YBR261C 699 nt5.97□□□□□ -1.45
YHC1Q05900 MPC2YHR162W 390 nt5.96□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 ARA2YMR041C 1008 nt5.96□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 YOL036WYOL036W 2286 nt5.96□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 YGL235WYGL235W 537 nt5.95□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 YHL017WYHL017W 1599 nt5.95□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 AIM20YIL158W 615 nt5.95□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 YKL153WYKL153W 510 nt5.95□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 YML083CYML083C 1257 nt5.95□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 FRE5YOR384W 2085 nt5.95□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 DAL4YIR028W 1908 nt5.95□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 PRP24YMR268C 1335 nt5.95□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 EFT2YDR385W 2529 nt5.94□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 EFT1YOR133W 2529 nt5.94□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 YPR196WYPR196W 1413 nt5.94□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 ICT1YLR099C 1185 nt5.94□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 YML6YML025C 861 nt5.94□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 HDA1YNL021W 2121 nt5.93□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 BIM1YER016W 1035 nt5.93□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.93□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 SCS22YBL091C-A 528 nt5.93□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 RIO1YOR119C 1455 nt5.93□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 FET4YMR319C 1659 nt5.93□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 RVB2YPL235W 1416 nt5.92□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 CDC1YDR182W 1476 nt5.92□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 PGK1YCR012W 1251 nt5.92□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 PPM1YDR435C 987 nt5.92□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 PET112YBL080C 1626 nt5.92□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 POP1YNL221C 2628 nt5.92□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 LAG2YOL025W 1983 nt5.91□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 GUD1YDL238C 1470 nt5.91□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 COX9YDL067C 180 nt5.91□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 EFM3YJR129C 1020 nt5.91□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 VPS24YKL041W 675 nt5.91□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 UBP13YBL067C 2244 nt5.91□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 WHI2YOR043W 1461 nt5.9□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 OSW2YLR054C 2175 nt5.9□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 ECM14YHR132C 1293 nt5.9□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 AAT2YLR027C 1257 nt5.9□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 YPR123CYPR123C 435 nt5.9□□□□□ -1.46
YHC1Q05900 ACS1YAL054C 2142 nt5.9□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 CRF1YDR223W 1404 nt5.9□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 YDR514CYDR514C 1452 nt5.9□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 TEP1YNL128W 1305 nt5.89□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 CNE1YAL058W 1509 nt5.89□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 YIL055CYIL055C 1884 nt5.88□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 YMR122CYMR122C 375 nt5.88□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 STB5YHR178W 2232 nt5.88□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 snR82snR82 268 nt5.87□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 COG1YGL223C 1254 nt5.87□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 RRS1YOR294W 612 nt5.87□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 HXK2YGL253W 1461 nt5.87□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 POX1YGL205W 2247 nt5.87□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 KKQ8YKL168C 2175 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 MNN5YJL186W 1761 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 PMP3YDR276C 168 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 RPT3YDR394W 1287 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 MSP1YGR028W 1089 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 YGR127WYGR127W 939 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 MRS1YIR021W 1092 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 PSR2YLR019W 1194 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 SCS7YMR272C 1155 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 YOL163WYOL163W 510 nt5.86□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 YEN1YER041W 2280 nt5.85□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 CDC34YDR054C 888 nt5.85□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 TFG2YGR005C 1203 nt5.85□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 FAF1YIL019W 1041 nt5.85□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 BCY1YIL033C 1251 nt5.85□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 TDH2YJR009C 999 nt5.85□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 MDM31YHR194W 1740 nt5.85□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 CSC1YLR241W 2349 nt5.85□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 RGD1YBR260C 2001 nt5.84□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 HST3YOR025W 1344 nt5.84□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 MAK31YCR020C-A 267 nt5.84□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 YET3YDL072C 612 nt5.84□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 OPI7YDR360W 435 nt5.84□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 TSA1YML028W 591 nt5.84□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 GLN1YPR035W 1113 nt5.84□□□□□ -1.47
YHC1Q05900 YLL067CYLL067C 3618 nt5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.3 ms