Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL23P62829 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL23P62829 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL23P62829 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL23P62829 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL23P62829 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL23P62829 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL23P62829 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL23P62829 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL23P62829 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL23P62829 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL23P62829 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL23P62829 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL23P62829 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL23P62829 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL23P62829 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL23P62829 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL23P62829 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL23P62829 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL23P62829 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL23P62829 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL23P62829 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL23P62829 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL23P62829 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL23P62829 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL23P62829 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL23P62829 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL23P62829 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23P62829 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23P62829 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23P62829 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23P62829 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23P62829 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23P62829 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23P62829 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL23P62829 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23P62829 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23P62829 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23P62829 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23P62829 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23P62829 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23P62829 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23P62829 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23P62829 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23P62829 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23P62829 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23P62829 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23P62829 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23P62829 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23P62829 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23P62829 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23P62829 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23P62829 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23P62829 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23P62829 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23P62829 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23P62829 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23P62829 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23P62829 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23P62829 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23P62829 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23P62829 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23P62829 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23P62829 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23P62829 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23P62829 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms