Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNB3P54284 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNB3P54284 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms