Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms