Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms