Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP5Q9BXF6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms