Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL3Q99963 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL3Q99963 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms