Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BCANQ96GW7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
BCANQ96GW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
BCANQ96GW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
BCANQ96GW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms