Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF6P62330 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF6P62330 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF6P62330 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF6P62330 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF6P62330 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF6P62330 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF6P62330 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF6P62330 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF6P62330 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF6P62330 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF6P62330 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF6P62330 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF6P62330 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF6P62330 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF6P62330 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF6P62330 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF6P62330 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF6P62330 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF6P62330 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF6P62330 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF6P62330 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF6P62330 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF6P62330 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF6P62330 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF6P62330 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF6P62330 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF6P62330 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF6P62330 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF6P62330 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF6P62330 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF6P62330 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF6P62330 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF6P62330 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF6P62330 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF6P62330 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF6P62330 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF6P62330 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF6P62330 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF6P62330 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF6P62330 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF6P62330 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF6P62330 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF6P62330 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARF6P62330 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARF6P62330 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ARF6P62330 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARF6P62330 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARF6P62330 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARF6P62330 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF6P62330 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF6P62330 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF6P62330 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF6P62330 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARF6P62330 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF6P62330 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF6P62330 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF6P62330 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF6P62330 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF6P62330 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF6P62330 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF6P62330 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF6P62330 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF6P62330 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF6P62330 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF6P62330 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF6P62330 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF6P62330 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF6P62330 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF6P62330 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms